1、目的蛋白信号弱。
2、转膜效率低。
3、显色或曝光后无条带。
4、背景过高。
5、注意事项。1、免疫印迹杂交的敏感与检测系统有关。因此,凝胶电泳时的蛋白上样量应该保洵翌绦枞证被检测抗原量不至于太低，如果过低应该重新纯化和浓偕媸蝾纱缩使用，或者建议做一次梯度稀释。2、形成凝胶的试剂要有足够的纯度,激活剂的浓度适当，不仅可以决定凝胶聚合的速度,也将影响凝胶的质量,聚胶时的温度也将影响凝胶聚合的速度。因此，建议要根据不同温度下适量增减激活剂的用量以保证分离胶从加入激活剂起至开始出现凝胶凝聚的时间为15-20分钟最佳,对于浓缩胶最佳聚合时间为8-10分钟开始可见聚合。灌完分离胶加水封闭分离胶与外界氧气的结合。3、未聚合的丙烯酰胺具有神经毒性,操作时应该戴手套口罩防护。梳子插入浓缩胶时，应确保没有气泡，可将梳子稍微倾斜插入以减少气泡的产生，梳子拔出来时应该小心,不要破坏加样孔，如有加样孔上的凝胶歪斜可用针头插入加样孔中纠正但要避免针头刺入胶内。4、加样前样品应先离心，尤其是长时间放置的样品,以减少蛋白质带的拖尾现象。5、为避免边缘效应，可在未加样的孔中加入等量的样品缓冲液。6、上样时，小心不要使样品溢出而污染相临加样孔。7、样品缓冲液中煮沸的样品可在-20℃存放数月，但是反复冻融会使蛋白质降解。8、为减少蛋白质条带的扩散,上样后应尽快进行电泳，电泳结束后也应尽快转印。9、取出凝胶后应注意分清上下，可用刀片切去凝胶的一角作为标记(如左上角)转膜时也应用同样的方法对PDVF膜做上标记(如左上角)以分清正反面和上下关系。10、转膜时应依次放好PDVF膜与凝胶所对应的电极,即凝胶对应负极,PDVF膜对应正极。
