1、引物长度:15-30bp为宜,常用20bp左右
2、引物扩增跨度:以200-500为宜
3、引物碱基:G陴鲰芹茯+C含量以40%-60%为宜,太少扩增效果不佳,过多易出现非特异性条带。ATGC最好随机分布。
4、避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3'瞿搋村乇端,容易出现引物二聚体,产生非特异性条带
5、引物3'端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基要严格配对,以免末端碱基不配对导致PCR失败
6、引物中加入合适的酶切位点
7、引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其他程序无明显同源性