1、第一步：人工打捞人工打捞收获藻类是控制蓝藻总量最直接的方式，能有效减轻局部的水华灾害，在收获藻类的同时起到输出营养物的作用，减轻藻体死亡分解引起的藻毒素污染。人工打捞收集手段落后，时间有限，导致效率低、费用高。
2、第二步：引水换水人工打捞完毕，对于含有较多蓝藻的池塘，经常、大量地换新鲜水，可稀释蓝藻的浓度，同时也可稀释蓝藻分泌的藻蓝素等有毒物质的浓度，促进其它藻类的生长，保持整个生态系统的动态平衡。可以使水体富营养化关键性水质指标总磷和有机物污染指标、高锰酸盐指数浓度等有所下降。
3、生物方法放养一定数量的滤食性鱼类。虽然蓝藻不易被消化，但由于其颗粒较大，更容易被滤食性鱼类摄食到体内，因此放养一定数量的滤食性鱼类有助于延缓、阻碍蓝藻的生长。可供选择的鱼类有白鲢、花鲢、白鲫等。实践表明，尾重200g以上的白鲢对蓝藻具有明显的抑制作用，当白鲢总量达到1500尾/亩时，蓝藻基本不会爆发。
4、生物竞争在晴天上午全池补充碳源，同时补充了池塘所需要的矿物质和一些利于有益藻繁殖的营养进去。泼洒小球藻，让小球藻等有益藻快速繁殖。接下来，用复合菌分解藻类死亡藻类，加大小球藻用量。继续补充一次藻种。
