CT检查有三种方法，一是平扫，为普通扫描，是常规检查；二是增强扫描，从静脉注入水溶性有机碘，再进行扫描，可以使某些病变显示更清楚；三是造影扫描，先行器官或结构的造影，再行扫描，如向脑池内注入造影剂或空气进行脑池造影，再扫描，可清楚显示脑池及其中的小肿瘤。
CT对所有器质性疾病都可以进行检查，尤其对密度差异大的器质性占位病变都能检查出来并做出定性诊断。但最适于CT检查的病是脑部疾病，其中对肿瘤、出血及梗塞等病检查效果最好，其次是腹部实质脏器的占位病变，如肝、脾、胰、肾、前列腺等部位的肿瘤，对乳腺、甲状腺等部位的肿块也能显示并做出诊断；再其次则是对胸腔、肺、心腔内的肿块，脊柱、脊髓、盆腔、胆囊、子宫等部位的肿块检查。CT对一些炎症及变异病变的检查效果稍差，如对肝炎，CT检查无多大价值，对胃肠道内病变的检查，CT不如内窥镜。
CT对肿瘤、肿块、出血等易于查出；但病变太小，尤其小于6毫米的病变，CT则难查出。
CT机属于放射线检查机器，所以有一定的放射线损伤，但人体所受的X线很少，每次检查所受的放射线仅比一般X光检查略高一点，一般不能引起损伤，但盲目的多次CT检查是不好的。
怀孕期间，做腹部CT检查要慎重，做其他部位检查时，也应对腹部采取一定的保护措施，以免X线对胎儿造成影响。
腹部检查之前不能做其它造影检查，尤其不能用钡剂行消化道造影，以免肠内残留的造影剂形成伪影，影响CT图像质量，从而导致误诊。
头部检查之前，应先照X线头颅平片和断层照片。
肝、胆、胰检查前，要先做各项化验检查，照腹部平片，胆道造影和超声检查。
肾脏检查前，应做肾盂造影和B超检查。
胸部检查前，应照胸部平片和断层照片。
脊柱检查前，要先行脊柱正侧、斜位照片等。
扫描前4小时禁食。在等待检查时，若因饥饿出现头晕、出冷汗等低血糖症状，可以饮糖水。腹部扫描前一周不吃含金属的药物，不做胃肠造影。
扫描过程中不要移动身体。
扫描中可能要用碘造影，有碘、青霉素过敏者应主动说明。 头颅扫描时要摘掉头上发夹、耳环等金属物品，眼睛闭上，不要看扫描架上的红灯，扫描部位如贴有膏药也应取下。
检查前要带上已做过的检查材料，如B超、X线片等。
