1、不损伤原防水层建造屋顶花园时必须进行二次防水处理，实施二次防水处理，最好先取掉屋顶的架空隔热层，取隔热层时，不得撬伤原防水层。取后要清扫、冲洗干净，以增强附着力。
2、重视施工质量屋顶花园防水层最好一次性全部施工完成，以免其中出现渗漏。防水层表面必须光洁平整，待施工璜模惜割完毕，刷2道防水涂料，以保证防水层的保护层设计与施工质量。要特别注意防水层的防腐蚀处理，防水层上的分隔缝可用“一布四涂”盖缝，并选用耐腐蚀性能好的嵌缝油膏。
3、注意材料质量应选择高温不流淌、低温不碎裂、不宜老化、防水效果好的防水材料。近年来，一些新型防水材料也开始投入使用，已投入屋顶施工的有三元乙丙卷材，使用效果不错。国外还有尝试用中空类的泡沫塑料制品作为绿化土层与屋顶之间的良好排水层和填充物，以减轻自重。
4、做防水实验做完二次防水处理后就要检查一下防水性。首先封闭出水口，再灌水，进行96小时的严格闭水试验。闭水试验中，要仔细观察房间的渗漏情况，有的房屋连续闭水3天不漏，第四天才开始渗漏。若能保证96小时不漏，说明屋面花园防水效果好。
5、检查排水系统防水层是保证屋顶不漏的关键技术问题，但是还必须处理好屋顶花园的排水系统。在屋顶园林工程中，种植池、水池和道路场地施工时，应遵照原屋顶排水系统，进行规划设计，不应封堵、隔绝或改变原排水口和坡度。
6、特别是大型种植池排水层下的排水管道，要与屋顶排水口配合，注意相关的标准差，使种植池排水层下的排水管道，要与屋顶排水口配合，注意相关的标高差，使种植池内的多余灌水能顺畅排出。
