1、不要让未经消毒的水体接触鼻腔。在不流动的水体、死水塘等游泳、洗脸时，大多数人都没有防护意思，任由水体接触鼻腔，极易导致食脑虫感染。做到了这条，基本可以避免感染。
2、在游泳时不要扰动沉积层。水体底部沉积层，有大量的腐烂物质，是食脑虫生长的乐园。扰动沉积层，会使大量的食脑虫飘浮进入水体之中，导致感染的机率增大。
3、在游泳时尽量使用鼻夹等防护物品。鼻夹可以有效堵住鼻腔与水体接触的通道，杜绝鼻腔与食脑虫接触，从而导致感染。其他一些防范物品，可以大量减轻食脑虫进入鼻腔的可能性。
4、不饮用和使用长期不流动的水体。因外出旅行等原因长期未在家，自来水管中的积水可能存在食脑虫，要将不流动的水体排放干净后，才能继续使用。
5、尽量不与水底淤泥形成的尘埃接触。在清理河道、池塘等时，清理出的淤泥要及时正常处理，不要放在阳光下曝晒，在空气中形成尘埃。虽然通过尘埃感染食脑虫的机率较少，但仍不排除此种可能性。
6、身体出现不适症状要尽快就医。在与不干净水体接触之后，如身体出现头痛、发热、呕吐、眩晕、嗜睡、精神错乱等症状时，要及时就医检查，尽早发现是否食脑虫感染，采取措施进行治疗。
