1、录音方式不同。MP3的录音一般是要采用菜单式进入方式，需要好几个步骤才可以进入录音模式。而专业的数码录音笔则具有一键录音功能，方便你随时随地一按即录。
2、有否有VOR(声控录音)。普通的MP3录音需要人手按下，被录音源中止发声时，又再次需要人手控制暂停录音，这样重复多次，就变得步骤很繁琐。而数码录音笔则只要开启VOR功能，有声音就录音，没有声音就暂停，更好地节省了存储空间。
3、录音格式不同。一般MP3的录音格式是ACT或WAV格式，录音后在电脑上可直接播放，但比较占用内存。而录音笔的录音音频有专用的格式，占用内存较小，录音时间长，但输出格式不能在电脑上直接播放，需要安装专用的播放软件。
4、是否有断电保护。如果在录音时，你使用的MP3突然没电了或出现死机，正在录音的文件不一定能保存下来；而录音笔则只要你一拿掉电池，正在录音的文件就会自动生成一个新的文件，保证你的录音不会丢失。
5、录音距离不同。MP3录音的录音距离一般在4到5米左右，而专业录音笔一般能在10米以上，并且具有定向录音，电话录音等功能。某些牌子的录音距离能达到15米左右，并且录音效果出色。即使你在百人大礼堂进行录音，其音质及防杂音效果也表现不错。
6、后期编辑方面。对于普通MP3随身听来说，如果遇到长达数小时的录音文件，而只需要听取其中一小段内容，那我们必须从头到尾将这个文件播放一遍，才能找到需要的地方，而且下次要听该段内容，又必须再次重复这一工作。这一耗精力的操作过程，真是太浪费时间了。而录音笔在后期用本身的专用软件就可轻松进行剪切、编辑，同时还可以将进行速度的快慢任意调节。
7、外接麦克风。普通的MP3只能用自身的内置麦克风，录音范围有所限制。而录音笔除了内置专业麦克风外，还可以外接麦克，以达到更加理想的录音效果。
8、录音效果不同。就录音而言，录音笔有一般有四个可选档，如长时间录音（LP），标准时间录音（SP），优质录音（HD），超高保真录音（SHD）。效果越好，可录音时间就越短。但MP3的录音选项就只有一档，就是普通录音，所以效果肯定比不上录音笔。另外，MP3的录音效果，一般会把周围的杂音都录下来，并且只能录单一方向内的声音，录音范围和距离也较近，录出的效果也不好。
