1、 1、确定申报的研究开发项目。企业研究开发费用认定是按照项目来进行申报，一家企业有多个项目的要逐个分别进行申报。
2、填写《企业研究开发项目确认书》，逐项准确完整填写，其中“研究开发项目所属技术领域”必须填写到小类，表格需经企业法定代表人签字并加盖公章。
3、填写《江苏省企业研发项目情况表》，该表格分为“自主开发”、“委托开发”、“合作开发”和“集中开发”四类，分别针对不同的研发项目类型，请根据项目情况选择洽当类型的表格进行填写。填写之前须认真阅读填写说明，按说明要求准确填写，企业法定代表人签字并加盖公章
4、附件材亓歃肿肖料。按照选定类别的“江苏省企业研发项目情况表”中第6项要求提供的材料进行准备，其中“研究开发项目计划书（包括预算报告和项目组编制情况及人员名单）可参考“研究开发项目计划书。除规定提供的附件材料外，对项目有佐证作用的有关认定证书（资料）、自主知识产权证明、政府立项文件等材料也可以作为附件一并提供。
5、材料装订。申报材料一律用A4纸打印或复印，按照《企业研究开发项目确认书》、《江苏省企业研发项目情况表》、附件的顺序装订成册。每个项目需要报送包括表格和附件在内的完整材料一式二份和一套单独的表格（包括“企业研究开发项目确认书”和“江苏省企业研发项目情况表”各一份）。
6、报送程序。一般市辖区企业向所在地区科技局报送申报材料，区科技局经审核、签署意见并盖章后交至市科技局。
7、取得确认和登记结果。项目通过专家评审确认后，将返回企业一份签署确认意见的《企业研究开发项目确认书》；同时，主管税务机关在审核通过后将签发《企业研究开发项目登记信息告知书》。
8、 8、申请所得税加计扣除。已取得税务部门发放《企业研究开发项目确认碜钓芡涸书》的企业，享受研究开发费用加计扣除时，应在俩乎馔像企业所得税年度纳税申报前按规定进行备案。在企业所得税年度纳税申报时，应按照研究开发项目类别，分别将实际发生的符合税收规定的研究开发费用，填报《研究开发项目可加计扣除研究开发费用情况归集表》，计算税前加计扣除额。委托开发项目，需同时报送受托方提供的《研究开发费用支出明细表（委托开发项目填报）》；集中开发项目，需同时报送研究开发费决算表、费用分摊表和实际分享收益比例等资料。
