1、重装机兵一代主角雷班纳隐退之后从事治理污染工作染毒身亡，留下女儿卡莲和本作主角。
2、一代机械师克里夫抚养了两个孩子，并在荒野的农场隐居。女战士英格丽特则仍然在外流浪，行踪不明。
3、在传说的大破坏发生之后，诺亚把自己的资料备份在一个精密的球形电子容器中，希望有朝一日获得重生。
4、此容器代号为“诺亚种子”，寓示着新生。一般人无法对其进行破坏和破解。
5、某天，故事从世界地图左侧的飓风石镇开始，镇上来了一名流浪猎人，自称刘陨厢豆疾风之杰西，寻找史上最强大的赏金猎人雷班纳。他看到流浪于此的孤儿琪琪，向其打听雷班纳的住处
6、此时，主角像往常一样睡懒觉起床吃饭，姐姐叫先去洗手。到水池边洗完坐到桌边。刚要开饭，不速之客，也就是杰西被琪琪带来这里。
7、发生了一些列误会之后，克里夫和姐姐明白了杰西的来意。原来杰西无意间得到了诺亚种子，前来寻求处理诺亚种子的方法。可雷班纳已经去世。克里夫独自去研究破坏诺亚种子的方法。主角继续在农场来回晃悠。
