1、管理范围的不同 ERP是对整个企业或企业集团业务的管理，而MES的管理是针对车间或生产分厂的。即使是功能最完备的MES系统，对整个企业来说，也只是提供了一个比较狭窄的视角，缺乏管理层管理和决策所需要数据的宽度和深度。
2、管理对象的不同 ERP是对企业整个运营资源(人、财、物)的管理，强调物流、资金流的统一，也即所谓的“业务财务一体化”。MES的管理则更集中于生产现场资源，即设备、工艺、物料等。
3、管理内容的不同 ERP管理整个企业的内部价值链和供应链，即销售、采购、生产、库存、质量、财务、人力资源等，强调所有这些业务的整合，强调计划(销售计划、生产计划、采购计划等)的协调和控制;MES主要管理生产的执行，包括生产质量、生产作业调度、生产实绩反馈等。
4、管理时效有别 ERP对计划和业务管惯栲狠疲理的时间区段比较宽，以年、季、月、旬或周、日为单位;由于对生产现场管控的需要，MES的管理更加细致，管到日、班、小时。在ERP系统产生的长亏坚橘锝期计划指导下，MES根据底层控制系统采集的生产实时数据，进行短期生产作业的计划调度、监控、资源配置和生产过程的优化等工作。
