全基因组重测序(Whole Genome Resequencing)

 时间:2024-11-02 02:15:09

全基因组重测序是对基因组序列已知的个体进行全基因组范围的测序,并在个体或群体水平上进行差异性分析的方法。随着基因组测序成本的不断降低,人类疾病的致病突变研究由外显子区域扩大到全基因组范围,通过构建全基因组文库,实现在全基因组水平上检测疾病关联的常见、低频、甚至是罕见的突变位点,以及结构变异等,具有重大的科研和产业价值。

工具/原料

1)检测疾病样本中高风险碱基变异位点和对应的基因;

2)配合大样本分析,确定孟德尔遗传疾病(Mendelian disease)相关SNP位点和基因;

3)在癌症研究过程中,检测癌症样本染色体上的突变位点、结构变异、染色体拷贝数变化以及潜在的融合基因;

4)用于种群遗传学的大规模样本基因组分析,检测SNP位点、LD并绘制种群图谱;

5)在染色体异常相关的疾病研究中,检测疾病样本中的染色体拷贝数异常;

6)用于个人基因组分析,结合数据库信息,建立个人SNP位点与疾病易感性、药物耐受性以及其他诸多表型之间的关系档案。

如您没有标准化的数据、只需流程中的局部分析内容或要求特立独行的数据分析思路,我们亦能满足您的要求。

数据处理和分析流程图

全基因组重测序(Whole Genome Resequencing)
全基因组重测序(Whole Genome Resequencing)

3、预期结果示例图展示示例图1 各类型SNV在样本中的个数统计。

全基因组重测序(Whole Genome Resequencing)

4、示例图2 不同类型外显子区域上的SNV类型统计。

全基因组重测序(Whole Genome Resequencing)

5、示例图3 融合基因预测[1]

全基因组重测序(Whole Genome Resequencing)

6、示例图4 大量样本的GWAS分析结果[2]

全基因组重测序(Whole Genome Resequencing)

7、示例图5 肿瘤样本高频率突变基因统计[3]

全基因组重测序(Whole Genome Resequencing)
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