1、协商解决。双方就赔偿问题进行协商，若达成了一致意见，则签订书面协议，按照协议约定行使权力、履行义务。
2、申请行政主管部门处理。协商不成，可以向卫生主管部门提出，让卫生主管部门处理或者帮助调解。
3、向法院起诉确权。若通过以上两种方法无法解决纠纷，此时则需要向人民法院起诉。1、诉前：书写起诉状、收集病例和其它证据材料；向人民法院提起诉讼。2、诉讼中：双方协商或者法院指定鉴定机构进行医疗事故鉴定，法院根据鉴定结果和其它证据进行依法裁判。3、诉讼后：法院判决后，双方依据生效判决书履行权利义务。4、在诉讼中，也可以由法院组织调解，双方达成调解义务，由法院出具调解书结案，双方依据调解书履行权利义务。
