原核生物和真核生物的结构基因不同：基因不同，构成不同。
一、基因不同：真核生物的染色体有组蛋白和非组蛋白结合，真核生物有断裂基因，即有内含子，转录产物是单顺反子，非编码区域多于编码区域。原核生物基因组很小，有重叠基因，转录产物是多顺反子，结构简练，大部分都是编码区域，dna一般不与蛋白质结合。
二、构成不同：原核生物的DNA的编码区是连续的，真核生物DNA的编码区是间断的，即真核生物的DNA的编码区有内含子和外显子，复制时同时复制内含子和外显子。原核生物的DNA的编码区没有内含子和外显子一说，全部是有遗传意义的片断，是完全翻译。
原核生物的多样性
虽然它不完全、虽然它简单，但是能在这个竞争激烈的环境中长久地活下去都会拥有自己的专属技能——原核生物的多样性。
比如细胞形态的多样性、运动的多样性、生长发育多样性、细胞结构多样性、细胞化学多样性、代谢功能多样性、遗传变异多样性等。所以它是有着极高利用价值的生物资源。这一资源不仅表现为与人类生存着动息息相关的几乎所有生物无穷的代谢功能性状，也同样表现为一个五彩缤纷的微生物世界。
