1、晚疫病。主要症状：叶上病斑黑色，常从叶尖发病，再向内曼延，严重时整叶焦枯，果实病斑初为水渍状，后呈云状；茎沃裎凄馈秆病斑黑色，不规则。药剂防治：发病前喷1：1：100倍波尔多液（即1份硫酸铜、即1份生石灰、即100份水分别溶解硫酸铜生石灰，并把这两种溶液倒入同一容器中，并不停搅拌，当溶液呈天蓝色即可使用，现配现用。），发病初期用64%杀毒矾500倍液或用甲霜灵锰锌500倍液或代森锰锌500倍液防治
2、青枯病。主要症状：病株白天萎蔫，傍晚恢复正常，保持绿色，不久枯萎而死。
3、枯萎病。主要症状：叶片先发黄后变褐色、干枯。后期大部叶片枯死，近地面茎、叶柄、果梗呈褐色。药剂防治：青枯病和枯萎病发生后拔除病株，在病株根部撒石灰，用50％多菌灵500倍液或用10％双效灵300倍液或70％根腐灵600倍灌根防治。
4、病毒病。分花蒺玫照秘叶病、蕨叶病、条斑病三种。花叶病表现为花叶斑驳，叶面凸凹不平，新叶小而皱缩，叶脉发紫，叶细长狭窄，扭曲畸形，植株矮小。蕨叶病叶片狭小，下部叶片上卷，上部叶片细小似缏堋垌胯线条状。条斑病上部叶片呈深绿色相间的花叶症状，茎秆中部初生暗绿色下陷短条斑，后呈褐色导致全株枯萎而死，果实上产生不规则的褐条斑，最后果实变形腐烂。番茄病毒病主要是蚜虫传播，所以要首先防治蚜虫。药剂防治：发病初用20％病毒灵400倍液或5％菌毒清200倍液或20％盐酸吗啉胍铜500倍液喷雾防治
5、棉铃虫(钻心虫)。幼虫蛀食在花蕾和果实，也蛀食嫩茎、叶和幼芽(现场拍虫及受害茎、叶、果实)。药剂防治：2．5%绿色功夫2000倍液或5％菜喜1000倍流48％乐斯本400倍液喷雾防治。
6、蚜虫。番茄整个生育期，均可危害茎、叶，并传播病毒病药剂防治：1.8％集畸虫满克2000倍液或10％吡虫啉3000倍液或5％卡死克1500倍液或50％抗蚜威、2500倍液喷雾防治。利用黄板诱杀成虫。各种药剂要交替使用，严格按照农药安全间隔期用药。
