1、关于巨齿鲨生死谜在生物学上，专家们早已给出定论：巨齿鲨已灭绝。有理论指出，由于巨齿鲨主要以鲸类为食，因两极的海水变冷而不适合巨齿鲨生存，鲸鱼因而可以逃避巨齿鲨的捕食，令巨齿鲨缺乏食物而灭绝。
2、根据加州大学古生物博物馆的资料，我们最早的智人祖先出现在距今约250万年前的更新世。但大约260万年前，在上新世末期，也就在人类出现之前，海洋中最致命的食肉动物巨齿鲨突然间消失了。很难确定巨齿鲨灭绝的确切时间，因为化石记录不完整。
3、有一种理论指出，水温降低是巨齿鲨死亡的原因之一。大约300万年前，连接大西洋和太平洋的中美洲海道关闭，大大降低了地球海洋的温度。一些研究人员认为巨齿鲨无法适应冷却的海水。然而，它们的猎物却可以适应，并进入到了那些较冷的水域。根据伦敦自然历史博物馆的说法，较冷的海水也杀死了巨齿鲨的一些食物来源。一旦海水冷却，多达三分之一的大型海洋动物就会遭到灭绝，这可能对巨齿鲨造成了严重的影响。然而，最近的研究表明，巨齿鲨的地理分布在温暖期并没有显著增加，在寒冷期也没有显著减少，这表明一定有其他原因导致了它们的灭绝。
4、还有一种说法，因为现在发现的巨齿鲨化石年份越来越新，并且疑似发现巨齿鲨的新闻层出不穷，所以巨齿鲨是否灭绝一直是一个谜。
