1、交易所所在地不同。沪市在上海市，深市在深圳市。
2、交易制度不同。沪市和深市基本的交易规则是一致的，差别在于收市最后3分钟（14:57~15:00），沪市是连续竞价，深市是集合竞价。
3、托管规则不同。沪市是采取的指定交易，深市则采取的“自动托管，随处通买，那买那卖，转托不限”。
4、股票板块、股票代码不同。沪市有主板、创业板与B股；深市有主板、中小板、创业板和B股。沪市主板是600开头，科创板是688开头，B股是900开头；深市主板是000开头，中小板是002开头、创业板是300开头、B股是200开头 。
5、B股标价不同。沪市B股是以美元竞价；深市B股是以港币竞价。
