哲宗的病情对外公开的说法是：“故冬以来，数冒大寒，浸以成疾，药石弗效，遂至垂危。”（绫戽醚黥卷7《元符遗制》）所幸，知枢密院事曾布的日志《曾公遗录》部分保存至今。从中可知，哲宗并非因伤寒感冒而死，而是死于性生理疾病。
由于赵氏家族有遗传的性生理疾病，哲宗此症原本并不明显。高后去世后，由于哲宗广招美女，夜夜笙箫，导致身体严重透支，这种病在当时几乎是致命的，而造成这种病的原因则是性生活的极度放纵。最终，在高太后去世八年后，宋哲宗赵煦也因为纵欲无度而身亡。
英年早逝
赵煦的身体一直很糟糕，少年时便有咯血等宿疾。元符二年（1099年）八月，赵煦宠爱的贤妃刘氏（即昭怀皇后）生下一个儿子赵茂，哲宗大喜，不顾阻力，封刘氏为皇后。
九月二十五日，赵茂夭折，赵煦悲痛不已，辍朝三日。四天之后，刘氏的小女儿扬国公主也暴病死去，宋哲宗又为之辍朝三日。这些事对赵煦造成不小的打击，加重了他的病情。
元符三年（1100年）正月，赵煦开始病重，无法上朝。同月十二日（2月23日），赵煦在福宁殿崩逝，年仅二十五岁，在位十五年。四月，谥号宪元显德钦文睿武齐圣昭孝皇帝，庙号哲宗。八月，葬于永泰陵。
