ImageJ是由NIH开发的一个基于java的公共的图像处理软件，可运行于 Windows，Mac OS，Mac OS X，Linux，和Sharp Zaurus PDA等平台。
工具/原料
Image J软件
1.Image J功能简介
1、常规功能：可以显示，编辑，分析，处理，保存，打印图片，其支持的图片格式有TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS等。
2、图像栈（stack）功能：在一个窗口里以多线程的形式层叠多个图像， 并行处理。在内存允许的条件下，ImageJ能打开许多的图片进行处理。
3、除此之外，ImageJ还能：1）进行图片的区域和像素统计， 间距，角度计算;2) 能创建柱状图和剖面图，进行傅里叶变换。
2.具体应用
1、图像的区域和像素统计（大小），长度，角度以及阳性点密度和数量。
2、光密度或辉度，并制备密度直方图和线性图。
3、两种蛋白共定位的程度。
3.Image主界面介绍
1、主面由菜单栏，工具栏和状态栏组成。
2、菜单栏包括：文件，编辑，图形，处理，分析，插件，窗口，帮助。文件主要有:文件打开，关闭，保存等功能，比较特殊的一个功能是恢复功能。可以直接回到上次保存过的状态。
3、编辑包括： Undo, Cut, Copy, Copy to system, Paste, Paste Control，Clear, 等.
4、图像：可改变图片格式，如彩色变灰度,。
5、处理：平滑、锐化、边缘寻找，找到最大值，提高对比度，噪声、阴影、二进制，数学，FFT，过滤器，批处理、图像计算器，减去背景，重复命令。分析：测量、分析 颗粒， 总结， 分布， 标签， 明确 结果， 集测量， 集规模， 校准， 直方图， 情节 剖面， 表面 情节， 凝胶， 工具。
6、工具栏从左至右的4种分别是：区域选择工具 ，直线选择工具，角度工具，点工具。
