手把手教你建立系统发育树

 时间:2024-10-12 01:42:20

1、打开NCBI:https://www.n罕铞泱殳cbi.nlm.nih.gov/,通过下拉列表的蛋白框,点击进入,输入蛋白序列号,下载你需要制作成发育树的蛋白序列。

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2、将下载好的发育树序列复制到一个文本中,如图中整理。

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3、下载并打开MAGE7.0软件

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4、在上方选择Align—Create a new alignment点击OK,选择蛋白序列。弹出第二窗口将文本文件全选—复制—粘贴进来。

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5、点击上方的手臂Align selscted with MUSCLE(就是手臂按钮)

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6、点击下拉列表,选择默认的值就可以,直接√,并在窗口左上方点击Data-Phylogenetic Analysis。

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7、窗口最小化,回到最原始的界面。编辑菜单中选择Phylogeny-Neighbor颍骈城茇-Joining Tree(采用邻接法)。改变选项中的参数为1000,下方点击√。

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8、此时软件就做好了系统发育树。

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9、如果对字体及字的大小不满意,可以对发育树进行修改。点击页面红色标记的地方,别忘了保存哟!至此发育树就完成了,希望大家都能做出自己满意的系统发育树。

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