1、我们咸犴孜稍先用最通俗易懂的语言来解释一下克隆:1+1=1。 1段目标序列插入1段质粒载体,获得1个目标质粒。怎样把目标序列插入到载体里呢?最经典的方法即是利用限制性内切酶法。常见做法包括:单酶切法和双酶切法。最重要的一点:不论单酶切还是双酶切,插入片段(非末端)不能含有拟选用限制性内切酶位点(序列)。
2、第一步:根据克隆目的选择酶切方法(单/双)。①如果只涉及(DNA向RNA)转录,不涉及(R鲍伊酷雪NA向蛋白质)翻译。即可不考虑插入序列方向,单酶切或双酶切均可。反之聩谳饨脍②,如须考虑插入序列方向性,建议优先选择双酶切法(如果选择单酶切法,筛选引物须注意方向)。
3、第二步:如果是双酶切,考虑插入末端类型。从成功率来说,粘性末端>平末端。所以优先粘性末端法连接或混合型。
4、第三步:考虑双酶切一步法还是两步法。一步法的前提是两种限制性内切酶可在相同buffer中反应。当然,双酶切(平末端)法中同样可能面临插入方向问题。建议优先选择双粘性末端或混合型。
5、第四步:如果不能避免(可用酶切位点少/破坏原有内切酶位点),可平末端法连接,然后通过筛选引物结合酶切或测序验证。
6、第五步:最后单独介绍一下如何破坏载体上原有限制性内切酶位点。分两种情况①单纯破坏位点,然后载体自连;②破坏位点然后插入目的序列。
7、第六步:针对情况①,可在两次酶切后统一进行(如T4 DNA聚合酶)平端化反应。
8、第七步:情况②根据后续操作依然可分为两种情况。如平端法插入目的片段,即在两次酶切后进行平端化;如为混合法插入目的片段,即须在第一次酶切后进行平端化(切记此时顺序不可错)。