1、一、组织招考部门的差别中央机关及其直属机构公务员的录用，由中央公务员主管部门负责组织;地方各级机关公务员的录用，由省级公务员主管部门负责组织。而事业单位考试又称事业编制考试，这项工作由各用人单位的人事部门委托省、级和地级市的人事厅局所属人事考试中心组织举行。
2、二、考试内容方面的差别公务员考试分为公共科目笔试和面试。而事业单位虽说一般都有笔试和面试，但少数地区只考笔试。 公务员的考试内容的难度比事业单位较大一些，公务员笔试内容一般是《行政职业能力测验》、《申论》。而事业单位笔试内容要就岗位而言，教育类笔试考教育学、教育心理学、教育法律法规等。卫生类考医疗卫生基础知识、基本技能等。综合类岗位考公共基础知识和职业能力测验。
3、三、日常工作性质的差别公务员，是指依法履行公职、纳入国家行政编制、由国家财政负担工资福利的工作人员。 而事业单位，是指国家为了社会公益目的，由国家机关举办或者其他组织利用国有资产举办的，从事教育、科技、文化、卫生等活动的社会服务组织。
4、四、薪资发放方面的差别公务员的工资收入是按照《国家公务员管理条例》的规定发放。而 事业单位人员的工资收入一般不受国家约定，由各事业单位根据市场情况而定。事业单位的工资形式有三种：全额国家财政拨款，差额的，国家只管编制和政策的。
5、五、保险福利的方面差别公务员享受的保险福利是按照《国家公务员管理条例》的规定执行;事业单位人员享受的保险福利是按照国家有关的社会保障规定执行，一般要逐步实行社会化。
