1、今天小编给大家介绍一款可以将序列可视化的软件,它是基于多序列比对,以图形的形式将保守区域展示出来,总高度表示此位置上的序列保守性,单个碱基代表出现的频率。
2、要是运行较大数据量时,建议使用本地化,不然就是后果自负。需要给它的输入文件与FASTA文件格式类似,可以直接将序列文件粘贴到框框中,也可以先将文件存储到本地,之后浏览上传本地文件。
3、Image Format & Size是参数主要是文件输出格式和图片大小。Advanced Logo Optio荏鱿胫协ns里边包括Sequence Type通常输入文件它会自动判断输入文件的类型,氨基酸或碱基两种。
4、Logo Range可以选择你想要画出的区域;这里它会有一稍僚敉视个小样品的校正功能建议勾上;Frequency Plot如果勾上就会将每个位点每个碱基的一个出现次数显示出来(高矮对应的出现多少),不会显示保守程度信息。
5、Advanced Image Options 里面调整的是高级图像设置,如Bitmap Resolution为做出图片的清晰度;Title标题等。
6、最后就是Colors调整,这个就看个人喜好。像小编这种对于颜色搭配上也是醉了的,通常选择默认了。