1、碧玺与水晶相似的外形，让很多消费者误认为高档的水萏舷噘祺晶就是碧玺，碧玺和水晶是同一种物品。其实，这种看法并不准确。目前市场上很多不专业的商家都把一些霏缢挝界低档碧玺和水晶一起来销售，并给客户介绍说碧玺就是水晶的一种。使得很多人都认为碧玺就是一种价格不高的水晶。实际上这是不对的，碧玺和水晶根本就是两种不同的矿物。在珠宝界里碧玺属于中高档宝石，优质的碧玺比钻石还要稀少。水晶则属于一般的宝石。
2、两者的化成分也不同，碧玺是一种复杂的硅酸盐，水晶是一种无色透明的大型石英结晶体矿物。水晶的主要化学成份是二氧化硅，当二氧化硅结晶完美时就是水晶；二氧化硅胶化脱水后就是玛瑙；二氧化硅含水的胶体凝固后就成为蛋白石；二氧化硅晶粒小于几微米时，就组成玉髓、燧石、次生石英岩。
3、由于瞍薅赀疖碧玺的化学成分复杂，目前还没有合成碧玺的出现。而合成的水晶饰品则遍布很多市场。1768年，瑞典著名科学家林内斯发现了碧玺受热具有压电性和热电佣甲昭宠性，因而矿物学名称为“电气石”。水晶则没有这种效应。碧玺的颜色也比水晶丰富许多，细分多达15种复色之多。碧玺的硬度也高于水晶，另外碧玺的磁场是同色系水晶的几十倍至上百倍。
4、碧玺的颜色过渡自然，而水晶显得不自然，跳跃比较大。没有经验的消费者一般是很难分辨的。目前还没有一种简单的方法能够快速分辨碧玺和水晶，两者的价值是相差甚远的，碧玺的价值要远高于水晶。
5、与缤纷的水晶、玛瑙、玉髓类半宝石相比，碧玺的产量相对较小，与红纹石、坦桑石、海蓝宝、尖晶石、摩根石等各新兴彩色宝石相比，碧玺的硬度尚可，在7-8之间，可以长期保存收藏，而色彩的丰富与鲜艳让其神秘多变，更具有佩戴价值。
