1、遗传因素：是指由于生殖细胞或受精卵的遗传物质发生改变引起的疾病。也就是说是来自父母的遗传因素所造成的出生缺陷。
2、环境因素：是指不良环境、有害物质等对母体、对胎儿健康的损害。诱发畸形的环境因素种类很多，范围也广，包括生物因素、化学因素、物理因素、营养因素、母体代谢不平衡等。
3、生物因素：是指孕期，特别是孕早期受到病毒、细菌、原虫等感染，而导致流产或畸形，其中以病毒感染最为突出。这些晾软粪削病原体例如风疹病毒、流感病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、水痘病毒、弓形体和梅毒螺旋体等，感染孕妇后，又通过血液循环感染胎儿，形成胎儿的先天缺陷，近些年来艾滋病病毒的感染也造成了很大的危害。
4、物理因素：射线、噪音、振动、高温、低温、机械损伤都会给胎儿造成危害，其中电离辐射是强烈的致畸因素。
5、化学因素：孕妇接触某些化学物质，如药物、化学制剂、工业“三废”、农业污染等都会给胎儿带来不同程度的损伤。
6、营养原因 : 是指孕妇在孕前后，由于营养不良、特别是微量元素和维生素摄入不足所造成的出生缺陷。另外，吸烟、酗酒、吸毒等搜视致畸的因素。孕妇代谢失调、食用有毒有害物质也会引起胎儿畸形。
