1、皮棉一般存放在专业的皮棉储备库内，目前国内的皮棉储备库房有砖混仓和钢板仓两种。
2、储存库要求交通便利、防火、通风、防潮、防霉变等，特别是防火，皮棉储备库都是特级防火单位。
3、一般来说皮棉应库内堆垛存放，库外存放要盖苫布。棉垛下要打好垫基（枕木或石块），堆垛时包应平放，上下层交叉压缝。垛与垛之间应留出必要的通道。
4、一般库内温度应保持在30℃以下，最高不得超过35℃，相对湿度不得超过70％，保管中的皮棉含水率不得超过10％。 皮棉在正常的储存条件下，保质期较长，但由于皮棉内含有一定的水份，在高温的情况下，尤其是温度超过35℃时，颜色可能会发生变化，出现自然变异，进而影响到皮棉的品级。
5、据有经验的棉皮棉仓库保管员分析，皮棉的自然变异呈“S”形，即开始变异较慢，中间一段时间变异较快，过了一定时间以后，其变异速度又变缓。
6、一般来说，符合国标规定水份的（含潮率不超过10.5％）新皮棉放置在正常保管的仓库内，夏热高温前一般不会发生自然变异，但夏天恝依在绌来临后，由于温度升高、湿度增大等原因，可能会引起皮棉自然变异，使新皮棉在一个皮棉年度内平均下降一个等级，并且品级越高，越稳定，品级越低，质量越不稳定，越容易发生自然变异。
